考馬斯亮藍（Coomassie brilliant blue）是兩種相似三苯甲烷染料的總稱，有G250和R250兩種，結構上前者比后者多了2個甲基，命名上“G”為Green 的縮寫，因G250的藍色染料泛淺綠色；命名上“R”為Red的縮寫，因R250的藍色染料呈微紅色調；“250”表示考馬斯亮藍的純度。生化實驗中常將考馬斯亮藍用于蛋白定量和蛋白電泳中蛋白染色。工作原理是：通過與蛋白質內的氨基和羧基基團間的靜電結合作用以及范德華力，考馬斯亮藍與蛋白質形成強但非共價鍵連接的復合物。蛋白-染料復合物的形成穩(wěn)定染料攜帶的負電荷陰離子（如磺酸基），從而產生在膜上或者膠上肉眼可見的藍色。

考馬斯亮藍R250（Coomassie brilliant blue R250）更多用于電泳蛋白的染色，染色靈敏度比氨基黑高5倍，可達0.1 µg蛋白。但是染色背景比較深，需要褪色后才能進行蛋白條帶的觀察?？捡R斯亮藍G250對蛋白膠染色的靈敏度相對較差，最低檢測到0.5 µg蛋白。但是因其在三氯乙酸中不溶而以膠體形式存在，選擇性的和蛋白質結合形成復合物，染色迅速，著色深的蛋白質條帶數(shù)秒內可以顯現(xiàn)出來，約45 min后著色最深。而且染色背景低，不需要脫色即可進行蛋白條帶的觀察。因此，非常適合對電泳凝膠蛋白的快速定性分析。

考馬斯亮藍G250較多的用于溶液體系中蛋白的定量分析，即Bradford蛋白結合檢測法（Bradford protein-binding assay），此方法利用的就是G250與蛋白質結合的特性，Bradford試劑（也就是酸化的G250溶液）為陽離子，主要為雙質子化，溶液為紅色，其最大吸收波長（Amax）為470 nm。當與蛋白穩(wěn)定結合后，G250以陽離子，非質子化的形式存在，溶液變?yōu)樗{色，最大吸收波長遷移到595 nm。藍色陽離子形式染料的量與樣本中蛋白的量成正比，因此通過直接測定595 nm的吸光度來反映蛋白量。此法的優(yōu)點在于G250與蛋白質結合所需的時間較短（約2 min左右），且結合的G250-蛋白質復合物室溫下約1 h內保持穩(wěn)定。反應靈敏度高，是一種非常常用的微量蛋白快速定量方法。

1.用于膠電泳蛋白染色。不用滲透到膠里就比萘酚藍黑B1（Naphthol Blue Black B1）靈敏度高3倍，簡單而又靈敏。

2.可以進行各種蛋白檢測，和勞里反應相牽連的化學物質和游離氨基酸對此蛋白染色檢測無任何影響。

3.P2X7嘌呤能受體激動劑。

考馬斯亮藍R250 和G250在用途上有什么區(qū)別?

R250中的R代表Red,偏紅,R250屬于慢染,脫色脫的完全,主要用于電泳染色
λmax=560―590nm.染色靈敏度比氨基黑高5倍.尤其適用于SDS電泳微量蛋白質染色.但蛋白質濃度超出一定范圍時,對高濃度蛋白的染色不符合Beer定律,用作定量分析時要注意.
G250中的G就是Green,偏綠,G250屬于快染,脫色脫的不徹底,主要用于蛋白測定
比考馬斯亮藍R250多二個甲基.;λmax=590―610nm.染色靈敏度不如R250,但比氨基黑高3倍.優(yōu)點在于它在三氯乙酸中不溶而成膠體,能選擇地染色蛋白而幾乎無本底色.所以常用于需要重復性好和穩(wěn)定的染色,適于作定量分析.